L'entretien est très simple et peut être assuré par une personne non spécialiste de la phytoremédiation. L’entretien correspond aux tâches suivantes :

• - Entretien du dégrilleur (une fois par semaine),
• - Inspection des ouvrages (dégradation des terrassements, des jointures de bâches, des canalisations...)
• - inspection du fonctionnement (observation des végétaux, répartition de l’eau, constitution de la couche de boue, colmatage),
• - Entretien des abords.